バイオインフォ

SNPcalling例1

#4【SNPcalling例1】Picardでマーキング

SNP callingはゲノムの変異を調べる解析です。この記事はコースになっており、前回はこちら、初回はこちらです。今回の記事ではPicardによるマーキングを行います!
SNPcalling例1

#3【SNPcalling例1】BWAでマッピング

SNP callingはゲノムの変異を調べる解析です。この記事はコースになっており、前回はこちら、初回はこちらです。今回の記事ではBWAによるマッピングを行います!
SNPcalling例1

#2【SNPcalling例1】TrimmomaticでQC

SNP callingはゲノムの変異を調べる解析です。この記事はコースになっており、初回はこちらです。今回の記事ではTrimmomaticを用いたリードのQCを行います!
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SNPcalling例1

#1【SNPcalling例1】目的とデータの準備

SNP callingはゲノムの変異を調べる解析です。本コースでは仮の状況を想定して、解析手法を説明して行きます。今回の記事では状況設定と解析の全体像を説明します。
02.Webサーバ体験1

#3【ラズパイWebサーバ】SSHの設定

基本情報技術者試験やプログラミング学習コースで基礎は身につけたけれど、実践が少なくて自信がイマイチな方へ。 本カテゴリーでは、Webサーバを自分で作り、Webアプリを1つ作るまでを連載して行きます。ツアーのようなものです。 「実際に何かを...
09.NGS softwares

#5【NGS】bowtie2のインストール

Linux初心者で、Wet系研究者の方へ。今回は「bowtie2」のインストール手順を解説します。動画(1分)もありますよ♪
09.NGS softwares

#4【NGS】STARのインストール

Linux初心者で、Wet系研究者の方へ。「STAR」のインストール手順を解説します。お急ぎの方は動画版(1分)をどうぞ♪
02.Webサーバ体験1

#2【ラズパイWebサーバ】ラズパイのIPアドレスを固定する

基本情報技術者試験やプログラミング学習コースで基礎は身につけたけれど、実践が少なくて自信がイマイチな方へ。 本カテゴリーでは、Webサーバを自分で作り、Webアプリを1つ作るまでを連載して行きます。ツアーのようなものです。 「実際に何かを...
02.Webサーバ体験1

#1【ラズパイWebサーバ】ラズパイを用意する

基本情報技術者試験やプログラミング学習コースで基礎は身につけたけれど、実践が少なくて自信がイマイチな方へ。 本カテゴリーでは、Webサーバを自分で作り、Webアプリを1つ作るまでを連載して行きます。ツアーのようなものです。 「実際に何かを...
09.NGS softwares

#3【NGS】samtoolsのインストール

Linux初心者で、Wet系研究者の方へ。「samtools」のインストール手順を解説します。お急ぎの方は動画版(2分)をどうぞ♪
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